Lek znajduje zastosowanie w terapii bardzo szerokiego spektrum schorzeń. Przede wszystkim jest stosowany w leczeniu substytucyjnym niewydolności kory nadnerczy, takiej jak choroba Addisona czy zespół nadnerczowo-płciowy, szczególnie po zakończeniu wzrostu pacjenta.
Choroby reumatyczne i zapalne
Esotkaleno wykazuje szczególną skuteczność w leczeniu chorób reumatycznych, w tym guzkowego zapalenia tętnic, olbrzymiokomórkowego zapalenia tętnic, polmialgii reumatycznej oraz zapalenia tętnicy skroniowej. Lek jest również stosowany w terapii ziarniniakowatości Wegenera, zespołu Churga-Strauss, tocznia rumieniowatego układowego oraz reumatoidalnego zapalenia stawów, szczególnie w jego ciężkich, postępujących postaciach.
Choroby układu oddechowego
W pulmonologii preparat znajduje zastosowanie w leczeniu astmy oskrzelowej, zaostrzeń przewlekłej obturacyjnej choroby płuc (POChP), a także różnych śródmiąższowych chorób płuc, takich jak ostre zapalenie pęcherzyków płucnych czy zwłóknienie płuc. Może być również stosowany w profilaktyce zespołu niewydolności oddechowej u wcześniaków.
Choroby skóry
Esotkaleno jest skuteczny w terapii wielu schorzeń dermatologicznych, które nie mogą być wystarczająco leczone preparatami miejscowymi. Należą do nich reakcje alergiczne i pseudoalergiczne, ciężkie postacie wyprysku (atopowego, kontaktowego), dermatozy pęcherzowe (pęcherzyca zwykła, pemfigoid pęcherzowy), zapalenia naczyń oraz choroby autoimmunologiczne skóry, takie jak zapalenie skórno-mięśniowe czy twardzina układowa.
Choroby oczu i neurologiczne
W okulistyce lek stosuje się w zapaleniach oka, neuropatii nerwu wzrokowego, chorobie Behceta, sarkoidozie czy orbitopatii endokrynologicznej. W neurologii znajduje zastosowanie w leczeniu miastenii, przewlekłego zespołu Guillaina-Barrégo, stwardnienia rozsianego oraz zespołu Westa u niemowląt.
Choroby hematologiczne i nowotworowe
Preparat jest wykorzystywany w terapii autoimmunologicznych chorób krwi, takich jak niedokrwistość hemolityczna czy plamica małopłytkowa. W onkologii znajduje zastosowanie w leczeniu ostrej białaczki limfoblastycznej, ziarnicy złośliwej, chłoniaków oraz jako element terapii paliatywnej w zaawansowanych chorobach nowotworowych.