Testowanie genetyczne w pospolitym zmiennym niedoborze odporności (CVID) staje się coraz ważniejszym narzędziem diagnostycznym, szczególnie w świetle postępów w technologiach sekwencjonowania nowej generacji (NGS)1. Chociaż większość przypadków CVID występuje sporadycznie, monogeniczna przyczyna została zidentyfikowana u 2-10% pacjentów z tym schorzeniem1.
Wskazania do testowania genetycznego
Testowanie genetyczne jest szczególnie przydatne w CVID, zwłaszcza u pacjentów z powikłaniami nieinfekyjnymi, dla których może kształtować leczenie2. Ocena genetyczna powinna być przynajmniej rozważana u pacjentów z ciężkimi powikłaniami, ponieważ może być ważna dla ukierunkowania leczenia i kontroli (np. niedobór LRBA/CTLA-4, APDS)3.
Monogeniczna przyczyna CVID jest bardziej prawdopodobna w przypadku wczesnego początku choroby (np. prezentacja w okresie niemowlęcym lub wczesnym dzieciństwie), pozytywnego wywiadu rodzinnego lub pokrewieństwa3. Testowanie genetyczne może być także rozważane w przypadkach z wczesnym wiekiem wystąpienia choroby lub z powikłaniami autoimmunologicznymi czy zapalnymi, u tych z innymi dotkniętymi członkami rodziny oraz w celu wykluczenia innych niedoborów odporności wynikających ze znanych defektów genetycznych4.
Dostępne metody testowania genetycznego
Obecnie dostępne są trzy poziomy testowania genetycznego jako badania kliniczne: testowanie paneli genów ukierunkowanych, badanie egzomu i badanie genomu, które dostarczają różnych poziomów informacji5. Większość lekarzy rozpoczyna od ukierunkowanego panelu genetycznego, ponieważ jest przystępny cenowo i dane są możliwe do zarządzania, szczególnie jeśli klinicysta nie jest immunologiem lub nie jest dobrze zaznajomiony z testowaniem genetycznym5.
Poprzez testowanie genetyczne klinicyści mogą zidentyfikować, czy istnieje genetyczna przyczyna objawów CVID5. Identyfikacja specyficznego wariantu genetycznego poprzez testowanie genetyczne, gdy uzyskuje się pozytywny wynik, może zapewnić ostateczną diagnozę i wpłynąć na leczenie6. Możliwość postawienia jasnej etykiety genetycznej i diagnostycznej jest bardzo pomocna zarówno dla pacjenta, jak i lekarza w zakresie prowadzenia6.
Wyzwania w interpretacji wyników genetycznych
Jednym z głównych wyzwań w testowaniu genetycznym CVID są warianty o nieznanym znaczeniu (VUS – variants of unknown significance)5. Celem dziedziny genetyki jest eliminacja VUS w niedalekiej przyszłości7. W rzeczywistości wiele genów początkowo zgłaszanych jako geny choroby CVID jest obecnie uważanych za odpowiedzialne za odrębne jednostki chorobowe1.
Ostatnie 4 lata przyniosły przyspieszenie odkrywania zarówno autosomalnych recesywnych, jak i dominujących genów choroby CVID dzięki technologiom sekwencjonowania nowej generacji (NGS)1. Coraz częściej uważa się, że oprócz rzadkich form monogenicznych, CVID jest zaburzeniem poligenicznym lub wieloczynnikowym3. Połączenie sekwencjonowania DNA z ekspresją genów, metylacją, danymi proteomicznymi i metabolomicznymi niesie obietnicę znacznego poszerzenia wiedzy o CVID8.
Konkretne defekty genetyczne i ich znaczenie kliniczne
Jednym z najlepiej scharakteryzowanych defektów genetycznych w CVID jest niedobór CTLA-4, którego fenotyp przypomina niedobór LRBA: autoimmunizacja, nawracające zakażenia, łagodna limfoproliferacja oraz różne poziomy Ig i defekty limfocytów B i T3. Te specyficzne defekty genetyczne mogą wymagać ukierunkowanego leczenia, co podkreśla znaczenie identyfikacji genetycznej.
Analiza genetyczna może być wykorzystana do kształtowania ukierunkowanej terapii2. Na przykład, pacjenci z defektami w genach CD40L i CD40, które są związane z zespołem hiper-IgM, wymagają innego podejścia terapeutycznego niż klasyczne CVID4. Testowanie genetyczne może również pomóc w określeniu, czy inni członkowie rodziny są dotknięci chorobą6.
Nowoczesne techniki diagnostyczne
Oprócz tradycyjnego testowania genetycznego, rozwijane są nowoczesne metody diagnostyczne. Spektroskopia FTIR (Fourier Transform Infrared) wykazała obiecujące wyniki w różnicowaniu pacjentów z CVID od zdrowych osób9. Metoda klasyfikacyjna oparta na regionie odcisku palca w surowicy była w stanie poprawnie rozróżnić do 99% spektrów reprezentatywnych dla kontroli i 92% spektrów reprezentatywnych dla choroby10.
Badanie wykazało skuteczność metod spektroskopowych FTIR w diagnostyce CVID, poprawnie segregując pacjentów z CVID i zdrowe kontrole do odpowiednich grup po analizie płynów biologicznych9. Zostało to wykonane przy użyciu modelu klasyfikacyjnego na regionie odcisku palca spektrum ATR-FTIR z czułością i swoistością wynoszącą 94% i 95% odpowiednio dla osocza oraz 97% i 93% odpowiednio dla surowicy9.
Znaczenie prognostyczne testowania genetycznego
Opracowane zostały także narzędzia prognostyczne wykorzystujące dane genetyczne i immunologiczne. Skala VISUAL (Variable Immunodeficiency Score by Upfront Analytical Link) wykorzystuje połączone biomarkery immunologiczne przy diagnozie CVID do przewidywania ciężkości manifestacji klinicznych11. VISUAL wykazał wyższą czułość i dokładność w przewidywaniu ciężkości niż marker zastępczy rutynowo używany w praktyce klinicznej, jakim jest sam fenotyp smB11.
Proponowana rozszerzona skala prognostyczna okazała się przydatnym narzędziem do klasyfikacji pacjentów z CVID przy diagnozie w celu antycypowania i dostosowania kontroli i prowadzenia11. Skala prognostyczna VISUAL może pozwolić na przewidywanie i tym samym lepsze ustalenie bardziej odpowiednich wymagań kontrolnych dla każdego indywidualnego pacjenta oraz uzupełnienie istniejących podejść w kierunku bardziej spersonalizowanej opieki12.
Perspektywy rozwoju i ograniczenia
Pomimo postępów w testowaniu genetycznym, do tej pory nie ma wytycznych klinicznych dotyczących genetycznej oceny pacjentów prezentujących się z CVID3. Ostatecznym celem jest poprawa przeżycia i wyników leczenia, a testowanie genetyczne jest dość integralne z diagnozą rzadkich chorób5.
Chociaż lekarze mogą różnić się w swoich opiniach na temat tego, czy i kiedy pacjent powinien przejść testowanie genetyczne, immunolodzy zazwyczaj popierają testowanie genetyczne7. Zachęcamy do testowania genetycznego, ponieważ chcemy wykorzystać wszystkie dostępne narzędzia do wczesnej diagnozy i lepszego prowadzenia choroby7. Potrzebne są dalsze badania, aby prospektywnie zwalidować skalę VISUAL i inne narzędzia prognostyczne12.













