Badania ścieków w wykrywaniu cyrkulacji wirusa polio

Nadzór środowiskowy nad poliovirusem stanowi jedno z najważniejszych narzędzi współczesnej epidemiologii w walce z chorobą Heinego-Medina. Ta zaawansowana metoda monitorowania polega na systematycznym badaniu próbek środowiskowych, głównie ścieków, pod kątem obecności poliovirusa1. Głównym celem nadzoru środowiskowego jest uzupełnienie nadzoru nad chorobami opartego na AFP w przypadku podejrzanych przypadków polio2.

Podstawy biologiczne nadzoru środowiskowego

Uzasadnienie dla nadzoru środowiskowego opiera się na charakterystycznym wzorcu wydalania poliovirusa. Zakażone osoby wydalają poliovirus z kałem przez okresy do kilku tygodni, niezależnie od tego, czy są objawowe, czy nie2. Duża liczba wydalanych cząstek poliovirusa pozostaje zakaźna w środowisku przez różne okresy, w zależności od bezpośrednich warunków ścieków2.

W związku z tym nadzór środowiskowy może dostarczyć cennych informacji, szczególnie w gęsto zaludnionych populacjach miejskich, gdzie nadzór AFP jest nieobecny lub słabej jakości, podejrzewa się uporczywą cyrkulację wirusa lub postrzega się częste ponowne wprowadzanie wirusa2. Ponieważ większość przypadków poliomyelitis jest bezobjawowa, ale wszystkie zakażone osoby wydalają wirus w swoim kale, nadzór środowiskowy ma tę zaletę, że pozwala nam wykryć obecność polio w danym obszarze przed pojawieniem się jakichkolwiek przypadków porażenia3.

Metody pobierania i analizy próbek

Celem nadzoru środowiskowego jest wykrycie cyrkulacji poliovirusa za pomocą pobierania próbek ścieków. Laboratoria polio wdrożyły programy nadzoru środowiskowego w kilku kluczowych krajach, mianowicie w Egipcie, Izraelu, Pakistanie, Indiach i Nigerii4. We wszystkich krajach, które używają nadzoru środowiskowego, zarówno izolaty dzikiego poliovirusa (WPV), jak i poliovirusa pochodzącego ze szczepionki (VDPV) są wykrywane z pobierania próbek ścieków środowiskowych4.

Proces analityczny obejmuje koncentrację tzw. próbek pobranych, przy użyciu metody dwufazowej (w Pakistanie, Egipcie i Nigerii) lub metody strącania (w Indiach), oraz izolację wirusa na komórkach permisywnych4. W Anglii próbki ścieków są pobierane miesięcznie z 28 oczyszczalni ścieków we współpracy z przedsiębiorstwami wodociągowymi i wysyłane do laboratorium MHRA do przetwarzania5.

Kluczowe elementy nadzoru środowiskowego: Skuteczne programy nadzoru środowiskowego muszą być opracowane w sposób czuły, z wystarczająco częstym pobieraniem próbek, odpowiednimi metodami izolacji i specjalnie ukierunkowanymi miejscami pobierania próbek w lokalizacjach o najwyższym ryzyku transmisji poliovirusa.

Rola w wykrywaniu cichej transmisji

Nadzór środowiskowy ma szczególne znaczenie w wykrywaniu tzw. „cichej transmisji” poliovirusa. Może pomóc w identyfikacji resztkowej transmisji dzikiego poliovirusa, na przykład tam, gdzie dziki poliovirus krąży wśród osób bezobjawowo zakażonych i nie wykazujących klinicznych oznak porażenia2. W Nigerii, chociaż cele nadzoru AFP nadal są spełniane we wszystkich stanach, dane wirologiczne wskazały, że sam nadzór AFP nie był wystarczająco czuły, aby wykryć wszystkie łańcuchy transmisji dzikiego poliovirusa w odpowiednim czasie4.

Wykrywanie tzw. „sierocych wirusów” (definiowanych jako poliovirusy, w których nukleotydy w 1,5% pozycji różnią się od tych znanych poliovirusów) w nadzorze środowiskowym wskazuje na niewykrytą transmisję poliovirusa, wspierając w ten sposób potrzebę poprawy czułości nadzoru4. Doświadczenia z kilku krajów potwierdzają, że nadzór środowiskowy może wykryć wprowadzenie i cichą cyrkulację dzikiego poliovirusa i poliovirusa pochodzącego ze szczepionki, czasami przed wystąpieniem jakichkolwiek przypadków AFP6.

Zastosowania w różnych krajach i regionach

Przykład Izraela z 2013 roku doskonale ilustruje wartość nadzoru środowiskowego. System nadzoru ścieków utworzony w 1989 roku przez izraelski departament zdrowia w celu wykrywania poliovirusa zabrzmiał alarm podczas wybuchu w 2013 roku7. W Izraelu próbki są automatycznie pobierane z magistrali ściekowych i oczyszczalni około raz w tygodniu w celu śledzenia polio w odpadach ludzkich7.

W Kanadzie, 23 grudnia 2022 roku, Agencja Zdrowia Publicznego Kanady wykryła pozytywne oznaki poliovirusa pochodzącego ze szczepionki w 2 próbkach ścieków pobranych w sierpniu 2022 roku z Montrealu w Quebecu8. Aby pomóc monitorować poliovirus, Krajowe Laboratorium Mikrobiologii (NML) testuje teraz ścieki pod kątem oznak poliovirusa w kluczowych obszarach wysokiego ryzyka o niskich wskaźnikach szczepień przeciwko polio8.

W Wielkiej Brytanii, w czerwcu 2022 roku, UKHSA ogłosiła, że nadzór środowiskowy nad polio uporczywie wykrywał poliovirus w próbkach ścieków pobranych z londyńskiej oczyszczalni ścieków Beckton od lutego 2022 roku5. WHO usunęło Wielką Brytanię z listy krajów zakażonych polio w grudniu 2023 roku po tym, jak przez okres 12 miesięcy nie było wykryć5.

Innowacje technologiczne: Opracowywane są nowe narzędzia do poprawy nadzoru środowiskowego, w tym system filtracji worka, który może skrócić czas przetwarzania próbki środowiskowej z jednego miesiąca do dwóch dni, znacznie przyspieszając wykrywanie i odpowiedź na potencjalne ogniska.

Znaczenie w strategii globalnej eradykacji

Nadzór środowiskowy odgrywa kluczową rolę w strategicznym planie GPEI na lata 2013-2018. Zostanie geograficznie rozszerzony, aby pomóc zidentyfikować wszelką resztkową transmisję w obszarach endemicznych poliovirusa, zapewnić wczesne wskazanie nowych importacji do obszarów wielokrotnie ponownie zakażanych oraz udokumentować eliminację wirusów Sabin po przełączeniu z tOPV na bOPV i ewentualnym zaprzestaniu stosowania tOPV9.

Nadzór środowiskowy powinien być dostępny i działać w krytycznym okresie między przerwaniem transmisji dzikiego poliovirusa a certyfikacją eradykacji polio, a także powinien być kontynuowany w okresie po eradykacji i zaprzestaniu stosowania doustnej szczepionki przeciwko polio (OPV) w celu monitorowania pojawienia się poliovirusów pochodzących ze szczepionki, ponownego pojawienia się dzikich poliovirusów lub zniknięcia wszystkich szczepów związanych z OPV10.

Wyzwania i ograniczenia

Pomimo swoich zalet, nadzór środowiskowy napotyka również pewne wyzwania. Pozytywne próbki polio ze środowiska jedynie ostrzegają urzędników zdrowia publicznego, że ma miejsce transmisja11. Nadzór środowiskowy może być jedynie uzupełnieniem nadzoru AFP, który nadal jest złotym standardem12. WHO pracuje nad opracowaniem zorganizowanych standardów nadzoru środowiskowego podobnych do dobrze ustanowionych standardów dla ostrego wiotkiego porażenia11.

Epidemiolodzy mogą następnie używać podejść modelowania do przekładu danych nadzoru na opisanie wzorców populacyjnych, umożliwiając urzędnikom zdrowia publicznego szybkie reagowanie na wybuchy11. W miarę jak zbliżamy się do końcowych etapów eradykacji polio, środki środowiskowe staną się jedynym wykonalnym sposobem wykrywania transmisji polio11.

Pytania i odpowiedzi

Dlaczego nadzór środowiskowy jest ważny w eradykacji polio?

Nadzór środowiskowy pozwala wykryć cyrkulację poliovirusa przed pojawieniem się przypadków porażenia, ponieważ wszystkie zakażone osoby wydalają wirus z kałem, niezależnie od obecności objawów. Jest to szczególnie ważne, gdy większość infekcji przebiega bezobjawowo.

Jak często pobierane są próbki ścieków w nadzorze środowiskowym?

Częstotliwość pobierania próbek różni się w zależności od kraju i sytuacji epidemiologicznej. W Izraelu próbki są pobierane automatycznie około raz w tygodniu, a w Anglii próbki ścieków są pobierane miesięcznie z 28 oczyszczalni ścieków.

Czy nadzór środowiskowy może zastąpić tradycyjny nadzór AFP?

Nie, nadzór środowiskowy może być jedynie uzupełnieniem nadzoru AFP, który nadal pozostaje „złotym standardem” wykrywania przypadków poliomyelitis. Oba systemy działają komplementarnie dla zapewnienia kompleksowego nadzoru.

Jakie są główne metody analizy próbek w nadzorze środowiskowym?

Główne metody to koncentracja próbek pobranych przy użyciu metody dwufazowej (w Pakistanie, Egipcie i Nigerii) lub metody strącania (w Indiach), oraz izolacja wirusa na komórkach permisywnych z następowym sekwencjonowaniem genetycznym.

Co to są „sierocze wirusy” w kontekście nadzoru środowiskowego?

„Sierocze wirusy” to poliovirusy wykryte w nadzorze środowiskowym, których sekwencja genetyczna różni się w 1,5% pozycji od znanych poliovirusów. Ich obecność wskazuje na niewykrytą transmisję poliovirusa i potrzebę poprawy czułości nadzoru.

Reklama
Reklama