Testy genetyczne i cytogenetyczne w zespole mielodysplastycznym

Badania cytogenetyczne i molekularne odgrywają fundamentalną rolę w diagnostyce zespołu mielodysplastycznego, dostarczając kluczowych informacji diagnostycznych, prognostycznych i terapeutycznych1. Cytogenetyka jest również istotną częścią procesu diagnostycznego i prognostycznego. Niestety, ponieważ mamy do czynienia z heterogenną grupą zaburzeń, w przeciwieństwie do wielu innych chorób, nie ma jednego specyficznego testu diagnostycznego ani definitywnych kryteriów diagnostycznych dla MDS.

Badania cytogenetyczne – kariotypowanie

Badania cytogenetyczne wykonywane są za pomocą kombinacji technik G-bandingu i fluorescencyjnej hybrydyzacji in situ (FISH)2. Chociaż mogą nie być wymagane do ustalenia diagnozy MDS, żadna diagnostyka nie jest kompletna bez ich wykonania. Kariotypowanie powinno być wykonane u wszystkich pacjentów, najlepiej na co najmniej 25 metafazach, gdy tylko jest to możliwe, i opisane zgodnie z zaleceniami Międzynarodowego Systemu.

Badanie cytogenetyczne szpiku kostnego odgrywa główną rolę w określaniu klonalności u pacjentów z MDS3. Obecność monosomii 5, 7 lub 13; delecji 5q, 7q i 13q; i(17p) i t(17p); delecji 11q; delecji 9q lub 12p lub t(12p), idic (X)(q13) pozwala na diagnozę MDS nawet przy braku zmian dysplastycznych.

Najczęstsze aberracje chromosomalne w MDS: Delecja 5q (del(5q)) występuje u około 15% pacjentów i wiąże się z lepszym rokowaniem. Delecja 7q lub monosomia 7 (-7) występuje u 10-15% przypadków i wskazuje na gorsze rokowanie. Delecja 20q (del(20q)) i trisomia 8 (+8) to kolejne częste zmiany cytogenetyczne4.

Wyniki badań cytogenetycznych, zarówno konwencjonalnego kariotypowania (G-banding) jak i testów fluorescencyjnej hybrydyzacji in situ (FISH), służą jako ważne parametry uwzględnione w zrewidowanym Międzynarodowym Systemie Oceny Prognostycznej (IPSS-R) dla MDS4. WHO w dużym stopniu opiera się na aberracjach cytogenetycznych w MDS.

Technika FISH

Fluorescencyjna hybrydyzacja in situ (FISH) jest techniką uzupełniającą kariotypowanie standardowe5. Testowanie FISH może pomóc w diagnostyce poprzez zrozumienie nasilenia zmian genetycznych, które mogły wystąpić, a także monitorować progresję choroby poprzez śledzenie poziomów nawracających nieprawidłowości podczas leczenia i nawrotu.

FISH pozwala na wykrycie specyficznych aberracji chromosomalnych z większą czułością niż klasyczne kariotypowanie. Technika ta jest szczególnie przydatna w przypadkach, gdy standardowe badanie cytogenetyczne nie daje jednoznacznych wyników lub gdy podejrzewa się obecność ukrytych klonów z aberracjami chromosomalnymi.

Sekwencjonowanie nowej generacji (NGS)

Pacjenci mają dostęp do szybkiego panelu hematologicznego – testu sekwencjonowania nowej generacji do identyfikacji mutacji lub alteracji DNA w 95 genach, które są często zmutowane w nowotworach krwi6. Wszyscy nowo zdiagnozowani pacjenci z MDS otrzymują skierowanie do programu genetycznego w celu oceny wszelkich dziedzicznych mutacji, które mogły przyczynić się do rozwoju MDS.

Testowanie genetyczne molekularne dla wariantów somatycznych (nazywanych również mutacjami nabytymi) w genach związanych z MDS jest zalecane i może pomóc w diagnostyce i rokowaniu7. Można testować szpik kostny lub krew obwodową. Nowoczesne ośrodki zwykle starają się uzyskać te informacje w ciągu 3-5 dni, co pomaga zrozumieć, czy dany pacjent ma korzystną, pośrednią czy niekorzystną cytogenetykę.

Kluczowe mutacje w MDS: Pięć lub sześć ważnych mutacji, których poszukuje się to FLT3, IDH1/IDH2, TP53, rearanżacje MLL, a teraz nowe mutacje jak CBL i KIT, dla których również dostępne są terapie celowane8. Mutacja SF3B1 wiąże się z obecnością syderoblastów pierścieniowych i lepszym rokowaniem.

Znaczenie prognostyczne badań genetycznych

Wyniki testów molekularnych dostarczają cennych informacji o chorobie i prawdopodobieństwie jej progresji do ostrej białaczki szpikowej6. Druga część informacji to dane o mutacjach molekularnych; uzyskanie ich trwa nieco dłużej, około 5-6 dni, aby otrzymać pełny 81-genowy panel mutacji molekularnych.

Kompleksowy system oceny cytogenetycznej został przyjęty przez WHO, który definiuje specyficzną stratyfikację prognostyczną MDS na podstawie istniejącego klonu cytogenetycznego4. Tradycyjne rozumienie, że obecność wyższych poziomów VAF (częstości allelu wariantowego) w diagnozie została powiązana z wczesnymi nabytymi klonami somatycznymi w MDS lub ostrej białaczce szpikowej.

Mutacje CHIP (klonalna hematopoeza o nieokreślonym potencjale) okazały się być jednymi z najwcześniejszych wydarzeń w patogenezie tych nowotworów mieloidalnych4. Zrozumienie sekwencji nabywania mutacji ma znaczenie dla rokowania i planowania terapii.

Wpływ na wybór terapii

W naszym ośrodku często zauważamy u pacjentów przychodzących z mniejszych ośrodków społeczności, że mogą nie mieć pełnych informacji o mutacjach lub mogą mieć bardzo ograniczone dane mutacyjne8. Często jesteśmy w stanie wykryć mutacje, które nie były znane lub zidentyfikowane na zewnątrz, a które faktycznie zmieniają wybór leczenia poprzez dostarczenie nowego celu, który został zidentyfikowany.

Uzyskanie tych informacji jest naprawdę kluczowe dla wyboru opcji leczenia. Nie ma już uniwersalnego podejścia do terapii MDS, ponieważ terapie są naprawdę dostosowywane na podstawie leżących u podstaw mutacji molekularnych, a obecnie mamy terapie celowane zarówno w MDS jak i ostrej białaczce szpikowej dla kilku różnych mutacji.

Badania dziedziczne

Wszyscy nowo zdiagnozowani pacjenci z MDS otrzymują skierowanie do programu genetycznego w celu oceny wszelkich dziedzicznych mutacji, które mogły przyczynić się do rozwoju MDS6. Jest to szczególnie ważne u młodszych pacjentów, gdzie prawdopodobieństwo zespołów predysponujących do nowotworów hematologicznych jest wyższe.

NCCN zaleca dodatkowe testowanie molekularne i genetyczne dla dziedzicznej predyspozycji do nowotworów hematologicznych u wybranej grupy pacjentów, szczególnie u młodszych pacjentów9. Identyfikacja dziedzicznych mutacji ma znaczenie nie tylko dla pacjenta, ale również dla członków rodziny, którzy mogą być narażeni na zwiększone ryzyko rozwoju nowotworów hematologicznych.

Przyszłość diagnostyki molekularnej

Bardzo prawdopodobne jest, że w niedalekiej przyszłości techniki nieinwazyjne, takie jak modelowanie diagnostyczne, cyfrowa analiza obliczeniowa i genetyka krwi obwodowej, indywidualnie lub w połączeniu, staną się częścią ogólnej praktyki w diagnostyce MDS10. W 2024 roku nadal jesteśmy na początku tej ery, a profil genetyczny, chociaż rutynowo określany w wielu częściach świata, nadal nie jest obowiązkowym narzędziem w diagnostyce.

Podsumowując, nie można nie docenić roli genetyki w diagnostyce, a także w patogenezie i rokowaniu2. Jednak w 2024 roku nadal jesteśmy na początku tej ery, a profil genetyczny, chociaż rutynowo wykonywany w wielu częściach świata, nadal nie jest obowiązkowym narzędziem w procesie diagnostycznym.

Pytania i odpowiedzi

Jakie są najczęstsze aberracje chromosomalne w MDS?

Najczęstsze to delecja 5q (del(5q)), delecja 7q lub monosomia 7, delecja 20q (del(20q)) oraz trisomia 8. Delecja 5q wiąże się z lepszym rokowaniem, podczas gdy zmiany w chromosomie 7 wskazują na gorsze rokowanie.

Czy badania cytogenetyczne są obowiązkowe w diagnostyce MDS?

Chociaż mogą nie być wymagane do ustalenia diagnozy, żadna pełna diagnostyka MDS nie jest kompletna bez wykonania badań cytogenetycznych. Mają one kluczowe znaczenie prognostyczne i terapeutyczne.

Jakie mutacje genowe są najważniejsze w MDS?

Kluczowe mutacje to TP53, SF3B1, FLT3, IDH1/IDH2, TET2, DNMT3A, ASXL1, CBL i KIT. Wiele z nich ma znaczenie prognostyczne i dla niektórych dostępne są już terapie celowane.

Ile czasu zajmuje otrzymanie wyników badań genetycznych?

Podstawowe wyniki cytogenetyczne są dostępne w 3-5 dni, podczas gdy pełny panel mutacji molekularnych (NGS) wymaga około 5-6 dni. Kompleksowa analiza może potrwać do 2 tygodni.

Czy wszystkich pacjentów z MDS należy badać pod kątem mutacji dziedzicznych?

Tak, wszyscy nowo zdiagnozowani pacjenci z MDS powinni otrzymać skierowanie do oceny genetycznej, szczególnie młodsi pacjenci, u których prawdopodobieństwo dziedzicznych zespołów predysponujących jest wyższe.

Reklama
Reklama