Białko fuzyjne EWS-FLI1 stanowi główny czynnik napędowy patogenezy mięsaka Ewinga poprzez złożone mechanizmy regulacji transkrypcyjnej. Jego unikalne właściwości strukturalne i funkcjonalne umożliwiają kontrolę nad setkami genów docelowych, prowadząc do transformacji nowotworowej komórek.
Wiązanie z DNA i rozpoznawanie sekwencji docelowych
EWS-FLI1 rozpoznaje i wiąże się z DNA poprzez dwa główne mechanizmy. Pierwszy polega na wiązaniu z konwencjonalnymi, niepowtarzalnymi motywami ETS, które są związane z aktywacją lub represją transkrypcji1. Drugi, bardziej charakterystyczny mechanizm, obejmuje wiązanie z microsatelitami GGAA, które służą jako elementy odpowiedzi na EWS-FLI11.
Microsatelity GGAA stanowią szczególnie ważne miejsca wiązania dla białka EWS-FLI1. Te powtarzalne sekwencje DNA są wykorzystywane nie tylko przez gen NR0B1, ale także przez wiele innych genów docelowych1. Białko EWS-FLI1 bezpośrednio wiąże się i aktywuje promotor GLI1, podczas gdy GLI1 z kolei aktywuje NKX2.21.
Regulacja ekspresji genów docelowych
Białko EWS-FLI1 wywiera swoje działanie przez masową deregulację ekspresji białek poprzez transkrypcyjną indukcję lub represję specyficznych genów docelowych, z których wiele jest zaangażowanych w proces onkogenny, w tym proliferację komórek, transformację i wzrost guza in vivo2.
Wśród kluczowych genów docelowych aktywowanych przez EWS-FLI1 znajduje się NKX2.2, który jest czynnikiem transkrypcyjnym zawierającym domenę wiążącą DNA typu homeodomena, jak również domeny aktywacji i represji transkrypcyjnej3. Identyfikacja NKX2.2 jako represora transkrypcyjnego ma ważne konsekwencje, ponieważ ta funkcja może być wykorzystana jako podejście terapeutyczne3.
EWS-FLI1 indukuje również ekspresję genów embrionalnych komórek macierzystych OCT4, SOX2 i NANOG oraz zwiększa ekspresję represora polycomb EZH24. Te geny są kluczowe dla utrzymania właściwości podobnych do komórek macierzystych i mogą przyczyniać się do agresywnego charakteru mięsaka Ewinga.
Interakcje białko-białko i kompleksy transkrypcyjne
Funkcjonowanie EWS-FLI1 jako czynnika transkrypcyjnego wymaga współdziałania z różnymi białkami regulatorowymi. Interakcje białko-białko mogą być celowane przez inhibicję helikaży RNA A, która wiąże się z EWS-FLI1 jako część kompleksu transkrypcyjnego5.
EWS-FLI1 współdziała również z PARP1, napędzając ekspresję PARP1, które z kolei promuje aktywację transkrypcyjną przez EWS-FLI16. Inhibicja PARP w mięsaku Ewinga zakłóca interakcję między EWS-FLI1 a PARP1 i upośledza naprawę DNA6.
Ważną rolę w funkcjonowaniu EWS-FLI1 odgrywają również białka BET (bromodomain and extra-terminal domain). Badania wykazały, że EWS-FLI1 wymaga białek BET do funkcjonowania, a inhibitor BET JQ1 jest wysoce toksyczny dla komórek mięsaka Ewinga7.
Wpływ na procesy komórkowe
EWS-FLI1 wpływa na wiele kluczowych procesów komórkowych. Białko to pozytywnie reguluje autofagię poprzez zwiększenie ekspresji ATG4B w komórkach mięsaka Ewinga2. ATG4B został znacząco zwiększony przez nadekspresję EWS-FLI1, a gen ATG4B może być transkrypcyjnym celem EWS-FLI18.
Białko fuzyjne reguluje również cykl komórkowy i procesy apoptotyczne. EWS-FLI1 aktywuje geny zaangażowane w różnicowanie komórkowe, proliferację i przeżycie, takie jak IGF1, NKX2, TOPK, SOX2 i EZH2, jednocześnie dezaktywując geny zaangażowane w apoptozę i cykl komórkowy, w tym IGFBP3, CDKN1C, CDKN1A i TGFB29.
Modulacja przez inne czynniki
Aktywność EWS-FLI1 może być modulowana przez inne białka. Przykładem jest ETV6, które moduluje zachowanie białka fuzyjnego EWS-FLI1 poprzez konkurowanie o miejsca wiązania na DNA10. ETV6 pośrednio promuje wzrost guza poprzez modulację zachowania EWS-FLI110.
Interesujące jest to, że ETV6 utrzymuje EWS-FLI1 pod kontrolą na DNA, co stanowi ważny mechanizm wzrostu guza10. Jedno białko wyłącza DNA, a drugie je włącza, co okazuje się być kluczem do tego mechanizmu molekularnego10.
Konsekwencje terapeutyczne
Zrozumienie mechanizmów działania EWS-FLI1 otwiera nowe możliwości terapeutyczne. Identyfikacja bezpośrednich genów docelowych aktywowanych przez EWS-FLI1 może informować skoncentrowane badania przesiewowe oparte na interferującej RNA w celu zdefiniowania genów, które są najważniejsze dla przeżycia i proliferacji komórek mięsaka Ewinga1.
Nadal obiecującym podejściem do odkrywania celów terapeutycznych w mięsaku Ewinga jest identyfikacja genów docelowych EWS-FLI1 w szlakach, które kodują znane cele lekowe1. To podejście może prowadzić do opracowania selektywnych terapii celowanych wykorzystujących unikalną zależność komórek mięsaka Ewinga od funkcji EWS-FLI1.













