Pantoprazol Aurovitas może wchodzić w interakcje z wieloma lekami, w tym z ketokonazolem, erlotynibem, warfaryną, inhibitorami proteazy wirusa HIV, metotreksatem, fluwoksaminą, ryfampicyną i zielem dziurawca zwyczajnego. Może również wpływać na wchłanianie witaminy B12. Brak bezpośrednich informacji na temat interakcji z alkoholem, ale zaleca się ostrożność.

