Aphtin Aflofarm może wchodzić w interakcje z lekami powodującymi przekrwienie błon śluzowych, co zwiększa wchłanianie boraksu. Stosowanie leku na uszkodzone błony śluzowe oraz u pacjentów z zaburzeniami czynności nerek wymaga ostrożności. Brak bezpośrednich informacji na temat interakcji z alkoholem, ale zaleca się konsultację z lekarzem.

