Aberracje genetyczne stanowią fundament patogenezy przewlekłej białaczki limfocytowej, determinując nie tylko rozwój choroby, ale także jej przebieg kliniczny i odpowiedź na leczenie1. Sekwencjonowanie nowej generacji w połączeniu z analizami liczby kopii genów umożliwiło odkrycie licznych uszkodzeń genetycznych, które są nawracające w tej chorobie1.
Najczęstsze aberracje chromosomalne
Badania kariotypowe ujawniły związek przewlekłej białaczki limfocytowej z delecją 13q14, trisomią 12, delecją 11q22-q23 oraz delecją 17p132. Nieprawidłowy kariotyp obserwuje się u większości pacjentów z przewlekłą białaczką limfocytową3. Najczęstszą aberracją jest delecja 13q, która występuje u ponad 50% pacjentów3.
Delecja 13q14 jest najczęstszą alteracją i występuje w 50-60% przypadków2. Ponieważ to uszkodzenie występuje z podobną częstością w MBL i często jest wykrywalne jako pojedyncze uszkodzenie, ta alteracja może reprezentować wczesne zdarzenie w chorobie2. Osoby wykazujące aberracje 13q14 mają stosunkowo łagodną chorobę, która zazwyczaj manifestuje się jako stabilna lub powoli postępująca izolowana limfocytoza3.
Trisomia 12 i jej znaczenie kliniczne
Obecność trisomii 12, która obserwuje się u 15% pacjentów z przewlekłą białaczką limfocytową, jest związana z atypową morfologią i progresywną chorobą3. Najczęstszą anomalią związaną z przewlekłą białaczką limfocytową jest trisomia 12, która została znaleziona u 67 (17%) z 391 ocenianych pacjentów5. Trisomia 12 jest obecna u 11-16% pacjentów i związana z pośrednimi wynikami; jednak patologiczne znaczenie tej alteracji numerycznej jest nadal nieznane6.
Znaczenie trisomii 12 w odniesieniu do rokowania w przewlekłej białaczce limfocytowej jest kontrowersyjne; niektórzy autorzy donoszą o złym rokowaniu i zaawansowanej chorobie u pacjentów z tą anomalią lub obecności limfocytów o morfologii podobnej do prolimfocytarnej7. Inni autorzy nie stwierdzili gorszego rokowania z tą anomalią7.
Delecje wysokiego ryzyka – 11q i 17p
Delecja 11q i 17p oraz trisomia 12 również zostały opisane, choć rzadziej3. Delecje w pasm 11q22-q23, obserwowane u 19% pacjentów, są związane z rozległym zajęciem węzłów chłonnych, agresywną chorobą i krótszym przeżyciem3. Chromosom 11q zawiera gen ataxia-telangiectasia mutated (ATM)8. Kinaza ATM jest odpowiedzialna za opóźnioną progresję cyklu komórkowego w obecności uszkodzenia DNA, umożliwiając komórce naprawę uszkodzenia8.
Delecja w krótkim ramieniu chromosomu 17 jest związana z szybką progresją, krótką remisją i zmniejszonym całkowitym przeżyciem3. Delecje 17p13 są związane z utratą funkcji genu supresorowego p533. W przewlekłej białaczce limfocytowej utrata 17p jest związana z najgorszym przeżyciem i najkrótszym czasem do leczenia, a także niepowodzeniem leczenia analogami nukleozydów purynowych i środkami alkilującymi9.
Mutacje wykryte sekwencjonowaniem nowej generacji
Pojawienie się technologii sekwencjonowania nowej generacji, w połączeniu z analizami liczby kopii genów, umożliwiło eksplorację genomu przewlekłej białaczki limfocytowej, odkrywając uszkodzenia genetyczne, które nawracająco dotykają tę białaczkę2. Ostatnio badania sekwencjonowania całego egzomu ujawniły nawracające uszkodzenia genetyczne, które dotykają genów zaangażowanych w różne szlaki biologiczne o potencjalnym znaczeniu patogenetycznym dla przewlekłej białaczki limfocytowej2.
Geny te obejmują NOTCH1, czynnik splicingowy 3b, podjednostkę 1 (SF3B1), BIRC3 oraz gen pierwotnej odpowiedzi różnicowania mieloidalnego 88 (MYD88)2. Badanie genomu przewlekłej białaczki limfocytowej przez Wang i współpracowników odkryło mutacje czynnika splicingowego 3b (SF3B1) wpływające na pre-mRNA w 15% próbkowanych komórek10. Mutacje SF3B1 są również znalezione w 20% przypadków zespołu mielodysplastycznego10.
Mutacje TP53 i ich znaczenie kliniczne
Delecja/mutacja punktowa TP53 prowadzi do przewlekłej białaczki limfocytowej8. Wiedza molekularna o genotypie przewlekłej białaczki limfocytowej znacznie rozwinęła zrozumienie genetycznych podstaw chemooporności11. Zaburzenie TP53 przewiduje niepowodzenie leczenia wieloma schematami i nakazuje stosowanie alternatywnych strategii terapeutycznych, które są bardziej skuteczne11.
Pomimo tych postępów aberracje TP53 nadal wywierają szkodliwy wpływ na rokowanie pacjentów z przewlekłą białaczką limfocytową poddawanych chemoimmunoterapii, podkreślając kluczową rolę markerów genetycznych w stratyfikacji i wyborze strategii terapeutycznych12. Znaczenie kliniczne mutacji TP53 o niskim obciążeniu jest dyskutowane. Niektóre badania sugerują, że pacjenci z klonami TP53 o niskim VAF mają takie samo niekorzystne rokowanie kliniczne jak pacjenci z wyższym VAF13.
Obciążenie mutacyjne i ewolucja klonalna
Średnio nowotwory przewlekłej białaczki limfocytowej akumulują około 2500 mutacji somatycznych z wyraźną różnicą między M-CLL i U-CLL (odpowiednio średnio 3000 vs 2000 mutacji somatycznych)14. To zwiększone obciążenie mutacyjne obserwowane w M-CLL ma ograniczony potencjał transformacji, ponieważ pacjenci z M-CLL mają mniej mutowanych genów kierujących i lepsze wyniki kliniczne niż pacjenci z U-CLL14.
Głębokie, ukierunkowane sekwencjonowanie nowej generacji ujawniło, że mutacje subklonalne (tj. te obecne tylko w części komórek nowotworowych) można wykryć dla wszystkich genów kierujących i są one związane z szybką progresją choroby i złym rokowaniem14. Liczba mutacji wpływa na rokowanie choroby. Więcej niż dwie mutacje są niezależnie związane z krótszym czasem do pierwszego leczenia15.
Zmiany epigenetyczne
Genom przewlekłej białaczki limfocytowej charakteryzuje się rozległą hipometylacją, a znaczna część różnic między U-CLL i M-CLL może być przypisana ich różnym komórkom pochodzenia w limfocytach B niezależnych lub doświadczonych w centrum germinacyjnym14. Główne zmiany hipometylacyjne występują w miejscach wiązania czynników transkrypcyjnych, takich jak TCF3, PU.1/SPIB, NFAT i EGR, oraz enhancerach modulujących geny istotne dla patogenezy przewlekłej białaczki limfocytowej zaangażowanych w funkcję limfocytów B, sygnalizację BCR i aktywację NF-κB między innymi14.
Przewlekła białaczka limfocytowa może być również spowodowana szeregiem zmian epigenetycznych, które są adaptacjami dodającymi znacznik do określonych sekwencji DNA, a nie zmieniającymi samą sekwencję16. W przewlekłej białaczce limfocytowej zmiany te można sklasyfikować na dodanie trzech różnych podgrup metylowych (podobnych do naiwnych limfocytów B, podobnych do limfocytów B pamięci i pośrednich), które wpływają na to, jak bardzo ta sekwencja DNA jest transkrybowana16.













