Nierodzinna hipogammaglobulinemia jest spowodowana problemami z układem odpornościowym, który nie produkuje wystarczająco dużo przeciwciał, co jest niezbędne do ochrony organizmu przed infekcjami. Uwarunkowania takie jak leki obniżające odporność, nowotwory krwi, wirusy, brak odżywiania mogą prowadzić do tego stanu.